Identités, cultures et contacts sont trois thématiques placées au cœur des recherches de trois équipes d'historiens, membres du Framespa : l'équipe 4, Religions, cultures, pouvoirs, l'équipe 9, Diasporas, et l'équipe 10, GRHI, le groupe de recherche en histoire immédiate. Leurs travaux de recherches embrassent une vaste période, depuis le Moyen Age finissant jusqu'à l'époque la plus contemporaine.

Les identités font l'objet de l'attention de l'équipe 4 qui groupe des médiévistes à travers l'interrogation des notions d'identités urbaines, de crises identitaires et de dissidences religieuses. L'équipe 9 a centré une grande partie de ses recherches sur l'histoire des Juifs dans la longue durée au travers de deux chantiers : l'histoire de leur intégration dans les sociétés modernes et celle, à l'inverse, des haines antisémites et de la Shoah. Le paradigme juif permet d'interroger d'autres minorités également traversées par les questions de l'identité, du contact, de la violence : c'est spécialement le cas des huguenots (les protestants français) et de leur exil européen aux 17e et 18e siècles. Parmi les chantiers en cours, des réflexions sur les lois du retour et sur les liens entre mémoires minoritaires et mémoire nationale ; la publication d'un Dictionnaire biographique des protestants français de 1789 à 2000 ; des contributions à la nouvelle histoire culturelle de la colonisation et aux mémoires de l'immigration. L'équipe publie depuis 2002 une revue semestrielle, Diasporas.Histoire et sociétés, autour de cette histoire comparée des minorités et des identités.

La construction des identités politiques et culturelles est aussi abordée par le biais des  idéologies du pouvoir et de la nation, et des conflits qu'elles engendrent, en particulier, la violence religieuse et politique depuis le Moyen Age jusqu'à l'époque contemporaine. L'équipe 10 réfléchit sur les mouvements identitaires en cours tout au long du XXème siècle et du début du XXIème siècle : identités qui se défont (le monde communiste, le monde colonial...), qui se font (le monde européen), qui se refont (Europe germanique, Moyen Orien chiite), et qui s'entrechoquent (ex-Yougoslavie, Pays des Grands Lacs...). Elle analyse la palette actuelle des échelles identitaires : de la dimension communale et cantonale aux dimensions nationales et internationales ; ainsi que les principaux ferments identitaires (religieux, ethniques, civilisationnels...) du XXème siècle.

Conjuguées au pluriel, les cultures sont indissociablement liées aux identités, cultures urbaines médiévales, représentations mentales, littéraires ou artistiques du pouvoir en Occident à la fin du Moyen Age.

Les politiques culturelles et la consommation des biens culturels sont étudiées depuis le Moyen Age jusqu'à l'époque la plus contemporaine. Une attention particulière est
portée aux nouvelles cultures, nées au cours du XXème siècle (photographie, cinéma, télévision, bande dessinée), à la culture régie (politiques étatiques ou locales)et à la culture vécue (pratiques des différents acteurs sociaux).

Ces cultures plurielles sont elles-mêmes le fruit de contacts plus ou moins pacifiques, depuis les croisades en passant par la colonisation et la décolonisation. La colonisation, le tourisme culturel à travers l'exemple du Maghreb, mais aussi la mémoire de l'immigration, tissent l'histoire de la relation France-Afrique, parmi bien d'autres.